N I S A W W
N F G S L L
V I C L I L
Q I L T G L
F 50
Pagophilus aat
atc tca gca tga tga aac ttt gga tcc ctg ctc gta atc tgc tta
atc cta cag atc cta aca ggc cta ttc
150
Phoca
... ... ... ... ... ... ... ... ... ..t ..t
... .g. ... ... c.. ... ..g
..t ... t.. ... ... t.g ...
Cystophora ..c
... ... ... ... ... ... ... ... ... ..c ... .g. ... ... ...
... t.. ... ... ... ... ... ... ...
Erignathus ..c
... ... ... ... ... ... ..c ... ... ..c ... .gg ... ... c.t
..t t.. ..a ... ... ... ... ... ...
L A M H Y T
S D T I T A
F S S V T H
I C R D V N
Y 75
Pagophilus ctg
gcc ata cat tat acc tca gac aca atc
aca gcc ttc tca tca gtg acc cat atc
tgt cga gac gta aac tac 225
Phoca
..a ... ... ..c ..c ... ... ... ... .c. ...
... ... ... ... ..a ... ..c ... ..c ... ...
... ... ...
Cystophora ..a
... ... ... ... ..t ... ... ... .ct ... ...
... ..g ... ..a ..a ..c ... ... ... ... ...
... ...
Erignathus ..a
... ... ... ..c ... ... ..t ... .c. ... ..t
... ... ... ..a ... ... ... ... ...
... ... ..t ..t
G W I I R Y
L H A N G A
S M F F I C
L Y M H V G
R 100
Pagophilus ggc
tga atc atc cga tac cta cac gca aat
gga gcc tcc ata ttt ttc atc tgc tta
tac ata cac gta gga cga 300
Phoca
... ... ... ... ..t ..t ..t ... ... ... ...
..t ... ... ... ... ... ... c.. ... ..g ..t
... ... ...
Cystophora ...
... ..t ... ... ..t ... ... ... ... ... ...
... ... ... ... ... ... c.g ... ... ... ..g
... ...
Erignathus ...
... ..t ... ... ..t a.. ... ..t ..c ... ..t
..t ... ..c ... ... ... c.. ... ... ..t ...
... ...
G L Y Y G S
Y T F T E T
W N I G I I
L L F T V M
A 125
Pagophilus gga
ctc tac tac ggt tcc tac aca ttc aca
gaa aca tga aat
atc ggc att atc ctc cta ttc acc gtc
ata gct 375
Phoca
... ..g ..t ... ..c ... ... ... ... ... ..g
... ... ..c ... ... ... ... ... t..
... ... ... ... ..c
Cystophora ...
..g ... ... ..c ... ... ... ..t ... ..g
... ... ... ... ... ... ... ... t..
..t ..t ... ... ...
Erignathus ...
..a ... ... ..c ..t ..t ... ..t .t. ...
... ... ..c ... ... ... ... ..a ...
... ... ... ... ..c
T A F M G Y
V L
133
Pagophilus acg
gca ttc atg ggt tac gtc cta cc
401
Phoca
..a ... ... ... ..c ... ... ... ..
Cystophora ..a
... ... ... ..c ... ... ... ..
Erignathus ..a
... ... ..a ..c ... ... ... ..
DNA sequence variation in true seals of the North Atlantic
401 base pair portion of the mitochondrial
cytochrome b gene from four species of phocid seals (Phoca
=
harbour seal, Pagophilus = harp seal, Cystophora = hooded
seal, Erignathus = bearded seal). Nucleotides are the same as
in Phoca except where indicated; the inferred amino acid sequence
for Phoca is indicated by the IUPAC single-letter code. Data from
Carr
and Perry (1997);
cf. Perry et al. (1995) "Journal of
Mammalogy," 76:22-31